EOMES

EOMES
Ідентифікатори
Символи EOMES, TBR2, Eomesodermin
Зовнішні ІД OMIM: 604615 MGI: 1201683 HomoloGene: 3971 GeneCards: EOMES
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, лімфогранульоматоз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
внутрішньоклітинний

Біологічний процес

stem cell population maintenance
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of neurogenesis
гаструляція
trophectodermal cell differentiation
skeletal muscle cell differentiation
адаптивна імунна відповідь
multicellular organism development
диференціація клітин
blastocyst development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cerebral cortex neuron differentiation
regulation of neuron differentiation
CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation involved in immune response
transcription, DNA-templated
olfactory bulb development
endodermal cell fate specification
cerebral cortex regionalization
cardioblast differentiation
процес імунної системи
positive regulation of cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
brain development
регуляція експресії генів
mesoderm formation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
mesodermal to mesenchymal transition involved in gastrulation
endoderm formation
cell differentiation involved in embryonic placenta development
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
Нейрогенез
neuron differentiation
endoderm development
anatomical structure morphogenesis
mesendoderm development

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8320
13813
Ensembl
ENSG00000163508
ENSMUSG00000032446
UniProt
O95936
O54839
RefSeq (мРНК)
NM_001278182
NM_001278183
NM_005442
NM_001164789
NM_010136
RefSeq (білок)
NP_001265111
NP_001265112
NP_005433
NP_001158261
NP_034266
Локус (UCSC) Хр. 3: 27.72 – 27.72 Mb Хр. 9: 118.31 – 118.32 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EOMES (англ. Eomesodermin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 72 732[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQLGEQLLVSSVNLPGAHFYPLESARGGSGGSAGHLPSAAPSPQKLDLDK
ASKKFSGSLSCEAVSGEPAAASAGAPAAMLSDTDAGDAFASAAAVAKPGP
PDGRKGSPCGEEELPSAAAAAAAAAAAAAATARYSMDSLSSERYYLQSPG
PQGSELAAPCSLFPYQAAAGAPHGPVYPAPNGARYPYGSMLPPGGFPAAV
CPPGRAQFGPGAGAGSGAGGSSGGGGGPGTYQYSQGAPLYGPYPGAAAAG
SCGGLGGLGVPGSGFRAHVYLCNRPLWLKFHRHQTEMIITKQGRRMFPFL
SFNINGLNPTAHYNVFVEVVLADPNHWRFQGGKWVTCGKADNNMQGNKMY
VHPESPNTGSHWMRQEISFGKLKLTNNKGANNNNTQMIVLQSLHKYQPRL
HIVEVTEDGVEDLNEPSKTQTFTFSETQFIAVTAYQNTDITQLKIDHNPF
AKGFRDNYDSSHQIVPGGRYGVQSFFPEPFVNTLPQARYYNGERTVPQTN
GLLSPQQSEEVANPPQRWLVTPVQQPGTNKLDISSYESEYTSSTLLPYGI
KSLPLQTSHALGYYPDPTFPAMAGWGGRGSYQRKMAAGLPWTSRTSPTVF
SEDQLSKEKVKEEIGSSWIETPPSIKSLDSNDSGVYTSACKRRRLSPSNS
SNENSPSIKCEDINAEEYSKDTSKGMGGYYAFYTTP

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, гаструляція, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kimura N., Nakashima K., Ueno M., Taga T. (1999). A novel mammalian T-box-containing gene, Tbr2, expressed in mouse developing brain. Brain Res. Dev. Brain Res. 115: 183—193. PMID 10407135 DOI:10.1016/S0165-3806(99)00064-4
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з EOMES переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3372 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, O95936 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.