ATG16L1

ATG16L1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

4GDK, 4GDL, 4NAW, 4TQ0, 5D7G

معرفات
أسماء بديلة ATG16L1, autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae), APG16L, ATG16A, ATG16L, IBD10, WDR30, autophagy related 16 like 1
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610767 MGI: MGI:1924290 HomoloGene: 41786 GeneCards: 55054
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ubiquitin-like protein transferase activity
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• identical protein binding
• GTPase binding

مكونات خلوية

• سيتوبلازم
• autophagosome
• ‏GO:0035085 خيط محوري
• عصارة خلوية
• phagophore assembly site membrane
• autophagosome membrane
• غشاء

عمليات حيوية

• protein transport
• التهام ذاتي
• negative stranded viral RNA replication
• protein homooligomerization
• macroautophagy
• autophagosome assembly
• protein localization to phagophore assembly site
• protein lipidation involved in autophagosome assembly
• أكل الأجانب
• positive regulation of autophagy

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 55054 77040
Ensembl ‏ENSG00000085978;db=core ENSG00000281089، ‏ENSG00000085978 ENSMUSG00000026289
يونيبروت

Q676U5
A0A024R494

Q8C0J2

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001190267، ‏NM_017974، ‏NM_030803، ‏NM_198890، ‏XM_005246084، ‏XM_005246086، ‏XM_006712608، ‏NM_001363742، ‏XM_047444848، ‏XM_047444849، ‏XM_047444850 NM_001190266، ‏NM_001190267، ‏NM_017974، ‏NM_030803، ‏NM_198890، ‏XM_005246084، ‏XM_005246086، ‏XM_006712608، ‏NM_001363742، ‏XM_047444848، ‏XM_047444849، ‏XM_047444850

‏NM_001205392، ‏NM_029846، ‏XM_036154331 NM_001205391، ‏NM_001205392، ‏NM_029846، ‏XM_036154331

RefSeq (بروتين)

‏NP_001177196، ‏NP_060444، ‏NP_110430، ‏NP_942593، ‏XP_005246141، ‏XP_005246143، ‏XP_006712671، ‏NP_001350671 NP_001177195، ‏NP_001177196، ‏NP_060444، ‏NP_110430، ‏NP_942593، ‏XP_005246141، ‏XP_005246143، ‏XP_006712671، ‏NP_001350671
NP_060444.3

‏NP_001192321، ‏NP_084122، ‏XP_036010224 NP_001192320، ‏NP_001192321، ‏NP_084122، ‏XP_036010224

الموقع (UCSC n/a Chr 1: 87.68 – 87.72 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

ATG16L1‏ (Autophagy related 16 like 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين ATG16L1 في الإنسان.[1]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Zheng H، Ji C، Li J، Jiang H، Ren M، Lu Q، Gu S، Mao Y، Xie Y (أغسطس 2004). "Cloning and analysis of human Apg16L". DNA Sequence. ج. 15 ع. 4: 303–5. DOI:10.1080/10425170400004104. PMID:15620219.

قراءة متعمقة

  • Venter JC، Adams MD، Myers EW، وآخرون (2001). "The sequence of the human genome". Science. ج. 291 ع. 5507: 1304–51. DOI:10.1126/science.1058040. PMID:11181995.
  • Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
  • Mizushima N، Kuma A، Kobayashi Y، وآخرون (2004). "Mouse Apg16L, a novel WD-repeat protein, targets to the autophagic isolation membrane with the Apg12-Apg5 conjugate". J. Cell Sci. ج. 116 ع. Pt 9: 1679–88. DOI:10.1242/jcs.00381. PMID:12665549.
  • Clark HF، Gurney AL، Abaya E، وآخرون (2003). "The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment". Genome Res. ج. 13 ع. 10: 2265–70. DOI:10.1101/gr.1293003. PMC:403697. PMID:12975309.
  • Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
  • Bouwmeester T، Bauch A، Ruffner H، وآخرون (2004). "A physical and functional map of the human TNF-alpha/NF-kappa B signal transduction pathway". Nat. Cell Biol. ج. 6 ع. 2: 97–105. DOI:10.1038/ncb1086. PMID:14743216.
  • Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
  • Zheng H، Ji C، Li J، وآخرون (2005). "Cloning and analysis of human Apg16L". DNA Seq. ج. 15 ع. 4: 303–5. DOI:10.1080/10425170400004104. PMID:15620219.
  • Kimura K، Wakamatsu A، Suzuki Y، وآخرون (2006). "Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. ج. 16 ع. 1: 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMC:1356129. PMID:16344560.
  • Hampe J، Franke A، Rosenstiel P، وآخرون (2007). "A genome-wide association scan of nonsynonymous SNPs identifies a susceptibility variant for Crohn disease in ATG16L1". Nat. Genet. ج. 39 ع. 2: 207–11. DOI:10.1038/ng1954. PMID:17200669.
  • Ewing RM، Chu P، Elisma F، وآخرون (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. ج. 3 ع. 1: 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC:1847948. PMID:17353931.
  • Prescott NJ، Fisher SA، Franke A، وآخرون (2007). "A nonsynonymous SNP in ATG16L1 predisposes to ileal Crohn's disease and is independent of CARD15 and IBD5". Gastroenterology. ج. 132 ع. 5: 1665–71. DOI:10.1053/j.gastro.2007.03.034. PMID:17484864.
  • Yamazaki K، Onouchi Y، Takazoe M، وآخرون (2007). "Association analysis of genetic variants in IL23R, ATG16L1 and 5p13.1 loci with Crohn's disease in Japanese patients". J. Hum. Genet. ج. 52 ع. 7: 575–83. DOI:10.1007/s10038-007-0156-z. PMID:17534574.
  • Baldassano RN، Bradfield JP، Monos DS، وآخرون (2007). "Association of the T300A non‐synonymous variant of the ATG16L1 gene with susceptibility to paediatric Crohn's disease". Gut. ج. 56 ع. 8: 1171–3. DOI:10.1136/gut.2007.122747. PMC:1955510. PMID:17625155.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 2
جينات الكروموسوم 2
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 2 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية