嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Alpha變異株

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SARS-CoV-2 变异株
Alpha
科学上准确的SARS-CoV-2的外部结构的原子模型。每个“球”都是一个原子。
科学上准确的SARS-CoV-2的外部结构的原子模型。每个“球”都是一个原子。
一般细节
世卫组织指称Alpha
谱系B1.1.1.7
首次检测到英格兰肯特郡
报告日期2020年11月,​3年前​(2020-11
地位需要关注的变异株英语Variant of concern
症状
  • 发冷
  • 食欲不振
  • 头痛
  • 肌肉疼痛
病例地图
截至2021年3月25日各地確診B.1.1.7譜系的總數[1]
圖示:
  超過10,000個確診個案
  5,000–9,999個確診個案
  1,000–4,999個確診個案
  500–999個確診個案
  100–499個確診個案
  2–99個確診個案
  1個確診個案
  無確診個案或無數據
主要变异株
  • BA.1 (B.1.1.529.1)
  • BA.2 (B.1.1.529.2)
  • BA.3 (B.1.1.529.3)
  • BA.4 (B.1.1.529.4)
  • BA.5 (B.1.1.529.5)

嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Alpha變異株(英語:SARS-CoV-2 Alpha variant),別名B.1.1.7譜系(英語:Lineage B.1.1.7),是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型(SARS-CoV-2)的一種變異株,世界衛生組織將其列為「高關注變異株」(VOC),原因是其傳播性較严重的嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型高70%[2]香港大學團隊估算傳播力高75%[3])。2020年11月2019冠狀病毒病英國疫情期間,此變種病毒在9月首次從英國採集的樣本中發現,並在12月中旬開始在該國快速傳播[4]

根據英格蘭公共衛生署2021年8月報告,2月至8月Alpha變異株病例死亡率1.1%,新版Delta變異株則0.3%(如只計無注射疫苗則0.21%)[5]

名稱

此變種病毒有多個名稱,在英國境外有時稱之為英國變種病毒[6](英語:U.K. variant 或 British variant)。在英國,因為此變種病毒首先在肯特郡被發現,所以在之後將其稱為肯特郡變種病毒(英語:Kent variant[7]

在科學用途中,此變種病毒起初被命名為VUI-202012/01(英語:First Variant Under Investigation in December 2020,意为“2020年12月首個被調查的變種”)[8],但在2020年12月21日發佈的報告中,英格蘭公共衞生部英语Public Health England將其重新歸類為值得關注的變種病毒[9]。在代表新冠病毒基因組學英國聯盟英语COVID-19 Genomics UK Consortium(COG-UK)撰寫的報告中,他們根據PANGOLIN的系統將其命名為B.1.1.7譜系。[10]

2021年5月31日,世界衛生組織為幾種主要的變異病毒株以希臘字母命名,以避免地名命名導致污名化的問題,其中B.1.1.7命名為Alpha,世衛表示此命名並不會取代科學名稱。[11]此后中国大陆媒体往往据此将其音译阿尔法毒株。台灣則直接稱作Alpha變異株

遗传图谱

SARS-CoV-2的突变是常见的:根据英国COVID-19基因组学联盟英语COVID-19 Genomics UK Consortium的数据,仅在其刺突蛋白中就检测到4000多个突变[13]

探测

属于B.1.1.7谱系的两个最早的基因组分别于2020年9月20日在肯特郡和9月21日在大伦敦采集[10]。这些序列被提交到全球共享流感数据倡议组织(GISAID)序列数据库(序列登录名分别为EPI_ISL_601443和EPI_ISL_581117)。截至12月15日,B.1.1.7谱系共有1623个基因组。其中519个样本在大伦敦,555个在肯特郡,545个在英国其他地区(包括苏格兰威尔士),4个在其他国家/地区[10]

使用遗传证据进行的反向追踪表明,这一新变种于2020年9月出现,然后以极低的水平在人群中传播,直到11月中旬。11月下旬,当英国公共卫生局英语Public Health England(PHE)正在调查为何肯特郡的感染率尽管受到国家限制而没有下降时,发现了与该新变种有关的病例。随后,PHE发现一个与这种变异体有关的簇(cluster)正在迅速蔓延到伦敦埃塞克斯郡[14]

症状

根据伦敦帝国理工学院英格兰100多万人进行的社区传播实时评估(REACT)研究,发现阿尔法变异株的一系列与COVID-19相关的额外症状,其中发冷食欲不振头痛肌肉酸痛是最典型的症状。[15][需要可靠醫學來源]

參見

参考文献

  1. ^ B.1.1.7 report. cov-lineages.org. [2021-01-29]. 
  2. ^ 成依華. 英國疫情|約翰遜:新變種病毒株傳播力高70% 提升倫敦防疫級別. 香港01. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-05-02). 
  3. ^ 陳樂彤. 新冠肺炎|英國變種病毒N501Y傳播力高75% 入侵香港恐令疫情失控【拆解7大常見Q&A】. 晴報. 2020-12-21 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-04-30). 
  4. ^ Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK. BBC News. 2020-12-20 [2020-12-24]. (原始内容存档于2020-12-21). 
  5. ^ SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England Technical Briefing 21 (PDF). Public Health England: 11. 2021-08-20 [2021-07-19]. (原始内容存档 (PDF)于2021-07-23) (英语). 
  6. ^ Boseley, Sarah. Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist. The Guardian. 10 February 2021 [10 February 2021]. (原始内容存档于2021-05-01). 
  7. ^ Boseley, Sarah. Mutated Kent Covid variant must be taken seriously, warns UK scientist. The Guardian. 2021-02-10 [2021-02-10]. (原始内容存档于2021-05-01). 
  8. ^ PHE investigating a novel strain of COVID-19. Public Health England. 2020-12-14 [2020-12-24]. (原始内容存档于2021-12-15). 
  9. ^ Variants: distribution of cases data. GOV.UK. At "Differences between a Variant of Concern and Varaint Under Investigation". 2021-01-28 [2021-02-19]. (原始内容存档于2021-06-07). 
  10. ^ 10.0 10.1 10.2 Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; Connor, Tom; Peacock, Tom; L. Robertson, David; Volz, Erik. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations (报告). Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. 2020-12-19 [2020-12-20]. (原始内容存档于2020-12-21). 
  11. ^ 徐榆涵. 避免汙名化!WHO宣布:改用希臘字母稱呼變種病毒. 聯合報 (聯合新聞網). 2021-06-01 [2021-06-01]. (原始内容存档于2021-06-03). 
  12. ^ Spike Variants: Alpha variant, aka B.1.1.7, 501Y.V1, 20I/501Y.V1, and UK COVID variant (页面存档备份,存于互联网档案馆) 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021
  13. ^ Wise, Jacqui. Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK. BMJ. 2020-12-16, 371: m4857. PMID 33328153. S2CID 229291003. doi:10.1136/bmj.m4857可免费查阅. 
  14. ^ COVID-19 (SARS-CoV-2): information about the new virus variant. Gov.uk. Public Health England. 2020-12-20 [2020-12-21]. (原始内容存档于2021-12-20). 
  15. ^ Roberts, Michelle. Headache and runny nose linked to Delta variant. BBC. 2021-06-14 [2021-09-23]. (原始内容存档于2022-01-03) (英语). 
SARSr-CoV
SARS-CoV-1相關病毒
人類病毒
蝙蝠病毒
HKU3 · Rm1 · Rf1 · Rp3 · Rs672 · SHC014 · WIV1 · LYRa11 · YNLF 31C · YNLF 34C · WIV16 · 16BO133
其他
SARS-CoV-2相關病毒
人類病毒
變異株
需要关注的变异株英语SARS-CoV-2 variant of concern(VOC)
Omicron(B.1.1.529)
子谱系:BA.1、BA.1.1、BA.2、BA.2.10.1、BA.2.12、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.2.86、BA.3、BA.4、BA.5、BA.5.2.1、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、CH.1.1、EG.5、EG.5.1、JN.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5、XBB.1.9.2、XBB.1.16、XBF、XE西班牙语Variante XE del SARS-CoV-2
原需要关注的变异株
Alpha(B.1.1.7)(带E484K版本)書面挪威語Lineage B.1.1.7 with E484K · Beta(B.1.351) · Gamma(P.1) · Delta(B.1.617.2)
需要留意的变异株阿拉伯语متحور مثير للاهتمام(VOI)
监视下的变异株阿拉伯语متحور قيد المراقبة(VUM)
Zeta英语SARS-CoV-2 Zeta variant(P.2) · Theta英语SARS-CoV-2 Theta variant(P.3) · Epsilon英语SARS-CoV-2 Epsilon variant(B.1.427、B.1.429書面挪威語Lineage B.1.429、CAL.20C) · Kappa(B.1.617.1) · Iota英语SARS-CoV-2 Iota variant(B.1.526) · Eta英语SARS-CoV-2 Eta variant(B.1.525) · Lambda(C.37) · Mu(B.1.621)
曾監視的變異株(FMV)
AV.1 · AT.1 · R.1西班牙语Variante R.1 del SARS-CoV-2 · B.1.466.2 · B.1.1.519 · C.36.3 · B.1.214.2 · B.1.1.523西班牙语B.1.1.523 · B.1.619 · B.1.620書面挪威語Lineage B.1.620 · B.1.1.318書面挪威語Lineage B.1.1.318/AZ.5 · C.1.2他加禄语SARS-CoV-2 Lineage C.1.2 · B.1.630 · B.1.640 · XD
其他变种
B.1.1.207書面挪威語Lineage B.1.1.207 · B.1.1.317 · B.1.616書面挪威語Den bretonske koronavarianten · B.1.618書面挪威語Lineage B.1.618 · B.1.640.2德语B.1.640.2 · Deltacron書面挪威語«Deltacron» · XF · Cluster 5英语Cluster 5(已消亡)
错义突变
del 69-70 · RSYLTPGD246-253N · N440K · G446V · L452R書面挪威語Mutasjon L452R · Y453F · S477G/N · E484Q書面挪威語Mutasjon E484Q · E484K書面挪威語Mutasjon E484K · F490S · N501Y書面挪威語Mutasjon N501Y · N501S · D614G書面挪威語Mutasjon D614G · Q677P/H · P681H書面挪威語Mutasjon P681H · P681R書面挪威語Mutasjon P681R · A701V書面挪威語Mutasjon A701B og mutasjon A701V
蝙蝠病毒
RaTG13 · RmYN02 · RacCS203英语RacCS203 · RshSTT182 · RshSTT200 · ZC45 · ZXC21 · Rc-o319
其他
穿山甲冠狀病毒(GD · GX · Pangolin-CoV-2020)
其他
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