兔冠狀病毒HKU14
兔冠狀病毒HKU14 | |
|---|---|
病毒分類  | |
| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 种： | 兔冠狀病毒HKU14 Rabbit Coronavirus HKU14 |
兔冠狀病毒HKU14（Rabbit Coronavirus HKU14、RbCoV HKU14）是乙型冠狀病毒屬的一種病毒，在中國廣州市場中的家兔體內被發現，於2012年由香港大學的研究人員發表[1]。
分類
兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1與中國鼠冠狀病毒HKU24皆是乙型冠狀病毒屬支序A（lineage A）的病毒，此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶（英语：Hemagglutinin esterase）（HE），其他冠狀病毒則無[2][3]。支序A中兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型的關係接近（較中國鼠冠狀病毒HKU24與乙型冠狀病毒1型的關係更為接近），因複製酶保守區域的胺基酸序列相似度小於90%而被認定是獨立物種[1]，不過仍有研究者將其視為乙型冠狀病毒1型的一個分型[4]。分子鐘分析顯示兔冠狀病毒HKU14是較近期才起源的病毒，可能於2002年左右才由共同祖先分支[1]。
基因組
兔冠狀病毒HKU14的基因組約長31000nt，編碼冠狀病毒皆有的複製酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）與衣殼蛋白（N）等四種結構蛋白，另外還有血細胞凝集素酯酶（英语：Hemagglutinin esterase）（HE）以及NS2a和NS5a兩種輔助蛋白，其基因順序為1ab-NS2a-HE-S-NS5a-E-M-N。乙型冠狀病毒屬支序A的病毒除人類冠狀病毒HKU1外，在1ab與HE間都有編碼輔助蛋白NS2a，不過兔冠狀病毒HKU14的NS2a並非像支序A的其他病毒一樣是單一開放閱讀框，而是斷裂成3–4個較小的開放閱讀框[1]。
其他兔冠狀病毒
1961年有北歐科學家發現用來培養梅毒螺旋體的兔子被未知病原感染，並偶爾造成死亡，1970年代此感染的死亡率一度高達七成，後來約翰霍普金斯大學研究證實此病原為冠狀病毒，但初步實驗結果顯示此病毒應屬甲型冠狀病毒屬，和兔冠狀病毒HKU14無關[1][5]。
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Fan, R. Y. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. F.; Tsang, A. K. L.; Lai, K. K. Y.; Chan, K.-H.; Che, X.-Y.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y. Isolation and Characterization of a Novel Betacoronavirus Subgroup A Coronavirus, Rabbit Coronavirus HKU14, from Domestic Rabbits. Journal of Virology. 2012, 86 (10): 5481–5496. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06927-11.
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738
. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
- ^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14.
- ^ Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008.
- ^ Small, J. David; Woods, Robert D. Relatedness of Rabbit Coronavirus to Other Coronaviruses 218: 521–527. 1987. ISSN 0065-2598. doi:10.1007/978-1-4684-1280-2_68.
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