PTPN3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/11/Protein_PTPN3_PDB_2b49.png/250px-Protein_PTPN3_PDB_2b49.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2B49, 4QUM, 4QUN, 4RH5, 4RH9, 4RHG, 4RI4, 4RI5, 4S0G | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPN3, PTP-H1, PTPH1, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 176877 MGI: 105307 HomoloGene: 74451 GeneCards: PTPN3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sodium channel regulator activity • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphotyrosine residue binding • ATPase binding • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • cytoplasmic side of plasma membrane • цитоскелет • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • regulation of membrane depolarization during action potential • GO:0016576 protein dephosphorylation • liver regeneration • regulation of sodium ion transmembrane transporter activity • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • negative regulation of mitotic cell cycle • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ec/PBB_GE_PTPN3_203997_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPN3_203997_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001145368 NM_001145369 NM_001145370 NM_001145371 NM_001145372
| NM_002829 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001138840 NP_001138841 NP_001138842 NP_001138843 NP_001138844
| NP_002820 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 109.38 – 109.5 Mb | Хр. 4: 57.19 – 57.3 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPN3 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 103 990[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTSRLRALGG | | RINNIRTSEL | | PKEKTRSEVI | | CSIHFLDGVV | | QTFKVTKQDT |
GQVLLDMVHN | | HLGVTEKEYF | | GLQHDDDSVD | | SPRWLEASKA | | IRKQLKGGFP |
CTLHFRVRFF | | IPDPNTLQQE | | QTRHLYFLQL | | KMDICEGRLT | | CPLNSAVVLA |
SYAVQSHFGD | | YNSSIHHPGY | | LSDSHFIPDQ | | NEDFLTKVES | | LHEQHSGLKQ |
SEAESCYINI | | ARTLDFYGVE | | LHSGRDLHNL | | DLMIGIASAG | | VAVYRKYICT |
SFYPWVNILK | | ISFKRKKFFI | | HQRQKQAESR | | EHIVAFNMLN | | YRSCKNLWKS |
CVEHHTFFQA | | KKLLPQEKNV | | LSQYWTMGSR | | NTKKSVNNQY | | CKKVIGGMVW |
NPAMRRSLSV | | EHLETKSLPS | | RSPPITPNWR | | SPRLRHEIRK | | PRHSSADNLA |
NEMTYITETE | | DVFYTYKGSL | | APQDSDSEVS | | QNRSPHQESL | | SENNPAQSYL |
TQKSSSSVSP | | SSNAPGSCSP | | DGVDQQLLDD | | FHRVTKGGST | | EDASQYYCDK |
NDNGDSYLVL | | IRITPDEDGK | | FGFNLKGGVD | | QKMPLVVSRI | | NPESPADTCI |
PKLNEGDQIV | | LINGRDISEH | | THDQVVMFIK | | ASRESHSREL | | ALVIRRRAVR |
SFADFKSEDE | | LNQLFPEAIF | | PMCPEGGDTL | | EGSMAQLKKG | | LESGTVLIQF |
EQLYRKKPGL | | AITFAKLPQN | | LDKNRYKDVL | | PYDTTRVLLQ | | GNEDYINASY |
VNMEIPAANL | | VNKYIATQGP | | LPHTCAQFWQ | | VVWDQKLSLI | | VMLTTLTERG |
RTKCHQYWPD | | PPDVMNHGGF | | HIQCQSEDCT | | IAYVSREMLV | | TNTQTGEEHT |
VTHLQYVAWP | | DHGVPDDSSD | | FLEFVNYVRS | | LRVDSEPVLV | | HCSAGIGRTG |
VLVTMETAMC | | LTERNLPIYP | | LDIVRKMRDQ | | RAMMVQTSSQ | | YKFVCEAILR |
VYEEGLVQML | | DPS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.
Література
- Yang Q., Tonks N.K. (1991). Isolation of a cDNA clone encoding a human protein-tyrosine phosphatase with homology to the cytoskeletal-associated proteins band 4.1, ezrin, and talin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 5949—5953. PMID 1648725 DOI:10.1073/pnas.88.14.5949
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9655 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P26045 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |