PAXIP1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3SQD

Ідентифікатори

Символи

PAXIP1, CAGF29, PACIP1, PAXIP1L, PTIP, TNRC2, CAGF28, PAX interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608254 HomoloGene: 133914 GeneCards: PAXIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• nuclear matrix • нуклеоплазма • MLL3/4 complex • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • хромосома
Біологічний процес	• response to ionizing radiation • positive regulation of histone H3-K36 methylation • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chorion development • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • transcription, DNA-templated • positive regulation of histone acetylation • cellular response to DNA damage stimulus • васкулогенез • positive regulation of isotype switching • histone H3-K4 methylation • positive regulation of histone H3-K4 methylation • adipose tissue development • double-strand break repair via nonhomologous end joining • positive regulation of protein ubiquitination • endothelial cell migration • GO:0100026 Репарація ДНК • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of cell cycle G2/M phase transition • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • positive regulation of response to DNA damage stimulus • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22976


449658

Ensembl


ENSG00000157212


ENSDARG00000005606

UniProt


Q6ZW49


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_007349


NM_001005929

RefSeq (білок)


NP_031375


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 7: 154.94 – 155 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PAXIP1 (англ. PAX interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 121 341^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDQAPKVPE	EMFREVKYYA	VGDIDPQVIQ	LLKAGKAKEV	SYNALASHII
SEDGDNPEVG	EAREVFDLPV	VKPSWVILSV	QCGTLLPVNG	FSPESCQIFF
GITACLSQVS	SEDRSALWAL	VTFYGGDCQL	TLNKKCTHLI	VPEPKGEKYE
CALKRASIKI	VTPDWVLDCV	SEKTKKDEAF	YHPRLIIYEE	EEEEEEEEEE
VENEEQDSQN	EGSTDEKSSP	ASSQEGSPSG	DQQFSPKSNT	EKSKGELMFD
DSSDSSPEKQ	ERNLNWTPAE	VPQLAAAKRR	LPQGKEPGLI	NLCANVPPVP
GNILPPEVRG	NLMAAGQNLQ	SSERSEMIAT	WSPAVRTLRN	ITNNADIQQM
NRPSNVAHIL	QTLSAPTKNL	EQQVNHSQQG	HTNANAVLFS	QVKVTPETHM
LQQQQQAQQQ	QQQHPVLHLQ	PQQIMQLQQQ	QQQQISQQPY	PQQPPHPFSQ
QQQQQQQAHP	HQFSQQQLQF	PQQQLHPPQQ	LHRPQQQLQP	FQQQHALQQQ
FHQLQQHQLQ	QQQLAQLQQQ	HSLLQQQQQQ	QIQQQQLQRM	HQQQQQQQMQ
SQTAPHLSQT	SQALQHQVPP	QQPPQQQQQQ	QPPPSPQQHQ	LFGHDPAVEI
PEEGFLLGCV	FAIADYPEQM	SDKQLLATWK	RIIQAHGGTV	DPTFTSRCTH
LLCESQVSSA	YAQAIRERKR	CVTAHWLNTV	LKKKKMVPPH	RALHFPVAFP
PGGKPCSQHI	ISVTGFVDSD	RDDLKLMAYL	AGAKYTGYLC	RSNTVLICKE
PTGLKYEKAK	EWRIPCVNAQ	WLGDILLGNF	EALRQIQYSR	YTAFSLQDPF
APTQHLVLNL	LDAWRVPLKV	SAELLMSIRL	PPKLKQNEVA	NVQPSSKRAR
IEDVPPPTKK	LTPELTPFVL	FTGFEPVQVQ	QYIKKLYILG	GEVAESAQKC
THLIASKVTR	TVKFLTAISV	VKHIVTPEWL	EECFRCQKFI	DEQNYILRDA
EAEVLFSFSL	EESLKRAHVS	PLFKAKYFYI	TPGICPSLST	MKAIVECAGG
KVLSKQPSFR	KLMEHKQNSS	LSEIILISCE	NDLHLCREYF	ARGIDVHNAE
FVLTGVLTQT	LDYESYKFN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Manke I.A., Lowery D.M., Nguyen A., Yaffe M.B. (2003). BRCT repeats as phosphopeptide-binding modules involved in protein targeting. Science. 302: 636—639. PMID 14576432 DOI:10.1126/science.1088877
Jowsey P.A., Doherty A.J., Rouse J. (2004). Human PTIP facilitates ATM-mediated activation of p53 and promotes cellular resistance to ionizing radiation. J. Biol. Chem. 279: 55562—55569. PMID 15456759 DOI:10.1074/jbc.M411021200
Patel S.R., Kim D., Levitan I., Dressler G.R. (2007). The BRCT-domain containing protein PTIP links PAX2 to a histone H3, lysine 4 methyltransferase complex. Dev. Cell. 13: 580—592. PMID 17925232 DOI:10.1016/j.devcel.2007.09.004
Munoz I.M., Jowsey P.A., Toth R., Rouse J. (2007). Phospho-epitope binding by the BRCT domains of hPTIP controls multiple aspects of the cellular response to DNA damage. Nucleic Acids Res. 35: 5312—5322. PMID 17690115 DOI:10.1093/nar/gkm493
Gohler T., Munoz I.M., Rouse J., Blow J.J. (2008). PTIP/Swift is required for efficient PCNA ubiquitination in response to DNA damage. DNA Repair. 7: 775—787. PMID 18353733 DOI:10.1016/j.dnarep.2008.02.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8624 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6ZW49 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.