NUP54

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4JNU, 4JNV, 4JO7, 4JO9, 5IJO, 5IJN

Ідентифікатори

Символи

NUP54, nucleoporin 54

Зовнішні ІД

OMIM: 607607 MGI: 1920460 HomoloGene: 41169 GeneCards: NUP54

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• Ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • Ядерна пора • nuclear pore central transport channel • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • host cell
Біологічний процес	• сортування білків • mRNA transport • protein heterotetramerization • protein localization to nuclear inner membrane • protein heterooligomerization • nucleocytoplasmic transport • regulation of protein import into nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • nuclear pore organization • NLS-bearing protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • protein heterotrimerization • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53371


269113

Ensembl


ENSG00000138750


ENSMUSG00000034826

UniProt


Q7Z3B4


Q8BTS4

RefSeq (мРНК)


NM_001278603 NM_017426


NM_183392 NM_001359995

RefSeq (білок)


NP_001265532 NP_059122


NP_899248 NP_001346924

Локус (UCSC)

Хр. 4: 76.11 – 76.15 Mb

Хр. 5: 92.56 – 92.58 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP54 (англ. Nucleoporin 54) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 507 амінокислот, а молекулярна маса — 55 435^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFNFGAPSG	TSGTAAATAA	PAGGFGGFGT	TSTTAGSAFS	FSAPTNTGTT
GLFGGTQNKG	FGFGTGFGTT	TGTSTGLGTG	LGTGLGFGGF	NTQQQQQTTL
GGLFSQPTQA	PTQSNQLINT	ASALSAPTLL	GDERDAILAK	WNQLQAFWGT
GKGYFNNNIP	PVEFTQENPF	CRFKAVGYSC	MPSNKDEDGL	VVLVFNKKET
EIRSQQQQLV	ESLHKVLGGN	QTLTVNVEGT	KTLPDDQTEV	VIYVVERSPN
GTSRRVPATT	LYAHFEQANI	KTQLQQLGVT	LSMTRTELSP	AQIKQLLQNP
PAGVDPIIWE	QAKVDNPDSE	KLIPVPMVGF	KELLRRLKVQ	DQMTKQHQTR
LDIISEDISE	LQKNQTTSVA	KIAQYKRKLM	DLSHRTLQVL	IKQEIQRKSG
YAIQADEEQL	RVQLDTIQGE	LNAPTQFKGR	LNELMSQIRM	QNHFGAVRSE
ERYYIDADLL	REIKQHLKQQ	QEGLSHLISI	IKDDLEDIKL	VEHGLNETIH
IRGGVFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Nucleoporin 54 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17359 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7Z3B4 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.