LIFR

LIFR
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3E0G

Ідентифікатори
Символи LIFR, CD118, LIF-R, SJS2, STWS, SWS, leukemia inhibitory factor receptor alpha, LIF receptor alpha, LIF receptor subunit alpha
Зовнішні ІД OMIM: 151443 MGI: 96788 HomoloGene: 1735 GeneCards: LIFR
Пов'язані генетичні захворювання
Stüve-Wiedemann syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• ciliary neurotrophic factor receptor activity
• growth factor binding
• oncostatin-M receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0016518 cytokine receptor activity
• ciliary neurotrophic factor receptor binding
• leukemia inhibitory factor receptor activity
• GO:0019974 cytokine binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• receptor complex
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• екзосома
• міжклітинний простір
• external side of plasma membrane

Біологічний процес

• response to cytokine
• leukemia inhibitory factor signaling pathway
• oncostatin-M-mediated signaling pathway
• cytokine-mediated signaling pathway
• ciliary neurotrophic factor-mediated signaling pathway
• cell surface receptor signaling pathway
• positive regulation of cell population proliferation
• regulation of cytokine-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3977
16880
Ensembl
ENSG00000113594
ENSMUSG00000054263
UniProt
P42702
P42703
RefSeq (мРНК)
NM_001127671
NM_002310
NM_001364297
NM_001364298
NM_001113386
NM_013584
NM_001358593
RefSeq (білок)
NP_001121143
NP_002301
NP_001351226
NP_001351227
NP_001106857
NP_038612
NP_001345522
Локус (UCSC) Хр. 5: 38.47 – 38.61 Mb Хр. 15: 7.12 – 7.23 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LIFR (англ. LIF receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 097 амінокислот, а молекулярна маса — 123 743[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMDIYVCLKRPSWMVDNKRMRTASNFQWLLSTFILLYLMNQVNSQKKGAP
HDLKCVTNNLQVWNCSWKAPSGTGRGTDYEVCIENRSRSCYQLEKTSIKI
PALSHGDYEITINSLHDFGSSTSKFTLNEQNVSLIPDTPEILNLSADFST
STLYLKWNDRGSVFPHRSNVIWEIKVLRKESMELVKLVTHNTTLNGKDTL
HHWSWASDMPLECAIHFVEIRCYIDNLHFSGLEEWSDWSPVKNISWIPDS
QTKVFPQDKVILVGSDITFCCVSQEKVLSALIGHTNCPLIHLDGENVAIK
IRNISVSASSGTNVVFTTEDNIFGTVIFAGYPPDTPQQLNCETHDLKEII
CSWNPGRVTALVGPRATSYTLVESFSGKYVRLKRAEAPTNESYQLLFQML
PNQEIYNFTLNAHNPLGRSQSTILVNITEKVYPHTPTSFKVKDINSTAVK
LSWHLPGNFAKINFLCEIEIKKSNSVQEQRNVTIKGVENSSYLVALDKLN
PYTLYTFRIRCSTETFWKWSKWSNKKQHLTTEASPSKGPDTWREWSSDGK
NLIIYWKPLPINEANGKILSYNVSCSSDEETQSLSEIPDPQHKAEIRLDK
NDYIISVVAKNSVGSSPPSKIASMEIPNDDLKIEQVVGMGKGILLTWHYD
PNMTCDYVIKWCNSSRSEPCLMDWRKVPSNSTETVIESDEFRPGIRYNFF
LYGCRNQGYQLLRSMIGYIEELAPIVAPNFTVEDTSADSILVKWEDIPVE
ELRGFLRGYLFYFGKGERDTSKMRVLESGRSDIKVKNITDISQKTLRIAD
LQGKTSYHLVLRAYTDGGVGPEKSMYVVTKENSVGLIIAILIPVAVAVIV
GVVTSILCYRKREWIKETFYPDIPNPENCKALQFQKSVCEGSSALKTLEM
NPCTPNNVEVLETRSAFPKIEDTEIISPVAERPEDRSDAEPENHVVVSYC
PPIIEEEIPNPAADEAGGTAQVIYIDVQSMYQPQAKPEEEQENDPVGGAG
YKPQMHLPINSTVEDIAAEEDLDKTAGYRPQANVNTWNLVSPDSPRSIDS
NSEIVSFGSPCSINSRQFLIPPKDEDSPKSNGGGWSFTNFFQNKPND

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Взаємодія

Показано, що рецептор інгібіторного фактора лейкемії взаємодіє з глікопротеїном 130.

LIFR також був ідентифікований як супресор метастазування раку молочної залози, який функціонує через шлях Hippo-YAP. LIFR знижено регулюється в ряді карцином молочної залози і може слугувати прогностичним інструментом.[6][7]

Література

  • Skiniotis G., Lupardus P.J., Martick M., Walz T., Garcia K.C. (2008). Structural organization of a full-length gp130/LIF-R cytokine receptor transmembrane complex. Mol. Cell. 31: 737—748. PMID 18775332 DOI:10.1016/j.molcel.2008.08.011

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LIFR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6597 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, P42702 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
  6. ↑ Timmermann, Andreas; Küster, Andrea; Kurth, Ingo; Heinrich, Peter C.; Müller-Newen, Gerhard (1 червня 2002). A functional role of the membrane-proximal extracellular domains of the signal transducer gp130 in heterodimerization with the leukemia inhibitory factor receptor: Heterodimerization of gp130 with LIFR. European Journal of Biochemistry (англ.). Т. 269, № 11. с. 2716—2726. doi:10.1046/j.1432-1033.2002.02941.x. Процитовано 29 травня 2023.
  7. ↑ Dual oncostatin M (OSM) receptors. Cloning and characterization of an alternative signaling subunit conferring OSM-specific receptor activation. The Journal of Biological Chemistry. 271 (51): 32635—43. December 1996. doi:10.1074/jbc.271.51.32635. PMID 8999038.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350