CDH9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDH9, cadherin 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609974 MGI: 107433 HomoloGene: 9450 GeneCards: CDH9 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ішемічна хвороба серця[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane • cell surface • catenin complex |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • synapse assembly • synaptic membrane adhesion • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 26.88 – 27.12 Mb | Хр. 15: 16.73 – 16.86 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDH9 (англ. Cadherin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789 амінокислот, а молекулярна маса — 88 689[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRTYHYIPLF | | IWTYMFHTVD | | TILLQEKPNS | | YLSSKKIAGL | | TKDDGKMLRR |
TKRGWMWNQF | | FLLEEYTGTD | | TQYVGKLHTD | | QDKGDGNLKY | | ILTGDGAGSL |
FVIDENTGDI | | HAAKKLDREE | | KSLYILRAKA | | IDRKTGRQVE | | PESEFIIKIH |
DINDNEPKFT | | KDLYTASVPE | | MSGVGTSVIQ | | VTATDADDAN | | YGNSAKVVYS |
ILQGQPYFSV | | DPESGIIKTA | | LPDMSRENRE | | QYQVVIQAKD | | MGGQMGGLSG |
TTTVNITLTD | | VNNNPPRFPQ | | STYQFNSPES | | VPLGTHLGRI | | KANDPDVGEN |
AEMEYSIAEG | | DGADMFDVIT | | DKDTQEGIIT | | VKQNLDFENQ | | MLYTLRVDAS |
NTHPDPRFLH | | LGPFKDTAVV | | KISVEDIDEP | | PVFTKVSYLI | | EVDEDVKEGS |
IIGQVTAYDP | | DARNNLIKYS | | VDRHTDMDRI | | FGIHSENGSI | | FTLKALDRES |
SPWHNITVTA | | TEINNPKQSS | | HIPVFIRILD | | INDHAPEFAM | | YYETFVCENA |
KPGQLIQTVS | | VMDKDDPPRG | | HKFFFEPVPE | | FTLNPNFTIV | | DNKDNTAGIM |
TRKDGYSRNK | | MSTYLLPILI | | FDNDYPIQSS | | TGTLTIRVCA | | CDNQGNMQSC |
TAEALILSAG | | LSTGALVAIL | | LCVLILLILV | | VLFAALKRQR | | KKEPLIISKD |
DVRDNIVTYN | | DEGGGEEDTQ | | AFDIGTLRNP | | EAREDSKLRR | | DVMPETIFQI |
RRTVPLWENI | | DVQDFIHRRL | | KENDADPSAP | | PYDSLATYAY | | EGNDSIADSL |
SSLESLTADC | | NQDYDYLSDW | | GPRFKKLADM | | YGGDDSDRD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1768 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9ULB4 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |