CCL16 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CCL16

Ідентифікатори

Символи

CCL16, CKb12, HCC-4, ILINCK, LCC-1, LEC, LMC, Mtn-1, NCC-4, NCC4, SCYA16, SCYL4, C-C motif chemokine ligand 16

Зовнішні ІД

OMIM: 601394 HomoloGene: 48291 GeneCards: CCL16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • CCR chemokine receptor binding • chemoattractant activity • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• monocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cell-cell signaling • cellular response to tumor necrosis factor • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • cell communication • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • inflammatory response • positive chemotaxis • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • eosinophil chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6360


н/д

Ensembl


ENSG00000275152 ENSG00000275095


н/д

UniProt


O15467


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_004590


н/д

RefSeq (білок)


NP_004581


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 35.98 – 35.98 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

CCL16 (англ. C-C motif chemokine ligand 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 120 амінокислот, а молекулярна маса — 13 600^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKVSEAALSL	LVLILIITSA	SRSQPKVPEW	VNTPSTCCLK	YYEKVLPRRL
VVGYRKALNC	HLPAIIFVTK	RNREVCTNPN	DDWVQEYIKD	PNLPLLPTRN
LSTVKIITAK	NGQPQLLNSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

Yang J.-Y., Spanaus K.S., Widmer U. (2000). Cloning, characterization and genomic organization of LCC-1 (scya16), a novel human CC chemokine expressed in liver. Cytokine. 12: 101—109. PMID 10671294 DOI:10.1006/cyto.1999.0548
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hedrick J.A., Helms A., Vicari A., Zlotnik A. (1998). Characterization of a novel CC chemokine, HCC-4, whose expression is increased by interleukin-10. Blood. 91: 4242—4247. PMID 9596672

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10614 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, O15467 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.