Циклін-залежна кіназа 7

CDK7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UA2

Ідентифікатори

Символи

CDK7, CAK1, CDKN7, HCAK, MO15, STK1, p39MO15, CAK, cyclin-dependent kinase 7, cyclin dependent kinase 7

Зовнішні ІД

OMIM: 601955 MGI: 102956 HomoloGene: 1363 GeneCards: CDK7

Реагує на сполуку

at-7519, AZD5438, sns-032, rgb-286638 free base, zotiraciclib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0001105 transcription coactivator activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • ATP binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • цитоплазма • cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex • transcription factor TFIIH holo complex • transcription factor TFIIK complex
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription • androgen receptor signaling pathway • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • фосфорилювання • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • клітинний цикл • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • snRNA transcription by RNA polymerase II • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • GO:0100026 Репарація ДНК • protein stabilization • G1/S transition of mitotic cell cycle • G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1022


12572

Ensembl


ENSG00000134058 ENSG00000277273


ENSMUSG00000069089

UniProt


P50613


Q03147

RefSeq (мРНК)

NM_001799 NM_001324069 NM_001324070 NM_001324071 NM_001324072
NM_001324074 NM_001324075 NM_001324077 NM_001324078


NM_009874

RefSeq (білок)

NP_001310998 NP_001310999 NP_001311000 NP_001311001 NP_001311003
NP_001311004 NP_001311006 NP_001311007 NP_001790


NP_034004

Локус (UCSC)

Хр. 5: 69.23 – 69.28 Mb

Хр. 13: 100.84 – 100.87 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDK7 (англ. Cyclin dependent kinase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 038^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALDVKSRAK	RYEKLDFLGE	GQFATVYKAR	DKNTNQIVAI	KKIKLGHRSE
AKDGINRTAL	REIKLLQELS	HPNIIGLLDA	FGHKSNISLV	FDFMETDLEV
IIKDNSLVLT	PSHIKAYMLM	TLQGLEYLHQ	HWILHRDLKP	NNLLLDENGV
LKLADFGLAK	SFGSPNRAYT	HQVVTRWYRA	PELLFGARMY	GVGVDMWAVG
CILAELLLRV	PFLPGDSDLD	QLTRIFETLG	TPTEEQWPDM	CSLPDYVTFK
SFPGIPLHHI	FSAAGDDLLD	LIQGLFLFNP	CARITATQAL	KMKYFSNRPG
PTPGCQLPRP	NCPVETLKEQ	SNPALAIKRK	RTEALEQGGL	PKKLIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Tassan J.-P., Schultz S.J., Bartek J., Nigg E.A. (1994). Cell cycle analysis of the activity, subcellular localization, and subunit composition of human CAK (CDK-activating kinase). J. Cell Biol. 127: 467—478. PMID 7929589 DOI:10.1083/jcb.127.2.467
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fisher R.P., Morgan D.O. (1994). A novel cyclin associates with MO15/CDK7 to form the CDK-activating kinase. Cell. 78: 713—724. PMID 8069918 DOI:10.1016/0092-8674(94)90535-5
Akoulitchev S., Reinberg D. (1998). The molecular mechanism of mitotic inhibition of TFIIH is mediated by phosphorylation of CDK7. Genes Dev. 12: 3541—3550. PMID 9832506 DOI:10.1101/gad.12.22.3541
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Schneider E., Montenarh M., Wagner P. (1998). Regulation of CAK kinase activity by p53. Oncogene. 17: 2733—2741. PMID 9840937 DOI:10.1038/sj.onc.1202504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cyclin dependent kinase 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1778 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P50613 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.