F11R

F11R
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1NBQ, 3EOY, 3TSZ, 4ODB

Идентификаторы
ПсевдонимыF11R, F11r, 9130004G24, AA638916, ESTM33, JAM, JAM-1, JAM-A, Jcam, Jcam1, Ly106, CD321, JAM1, JAMA, KAT, PAM-1, F11 receptor
Внешние IDOMIM: 605721 MGI: 1321398 HomoloGene: 14255 GeneCards: F11R
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме F11R
Расположение в геноме F11R
Локус1q23.3Начало160,995,211 bp[1]
Конец161,021,343 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме F11R
Расположение в геноме F11R
Локус1 H3|1 79.43 cMНачало171,265,103 bp[2]
Конец171,292,171 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung

  • minor salivary glands

  • skin of abdomen

  • left lobe of thyroid gland

  • body of pancreas

  • right uterine tube
Наибольшая экспрессия в
  • saccule

  • otic placode

  • left lung lobe

  • epithelium of stomach

  • left colon
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • PDZ domain binding
  • virus receptor activity
  • связывание с белками плазмы
  • cadherin binding
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • мембрана
  • cell-cell junction
  • bicellular tight junction
  • клеточная мембрана
  • slit diaphragm
  • экзосома
  • цитоплазматическая везикула
  • межклеточные контакты
Биологический процесс
  • regulation of actin cytoskeleton reorganization
  • дифференцировка клеток
  • establishment of endothelial intestinal barrier
  • epithelial cell differentiation
  • actomyosin structure organization
  • extracellular matrix organization
  • regulation of membrane permeability
  • regulation of cytokine production
  • positive regulation of GTPase activity
  • Повышение кровяного давления
  • агрегация клеток
  • negative regulation of GTPase activity
  • bicellular tight junction assembly
  • viral entry into host cell
  • intestinal absorption
  • response to radiation
  • воспалительная реакция
  • вирусный процесс
  • transforming growth factor beta receptor signaling pathway
  • leukocyte migration
  • protein localization to plasma membrane
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

50848

16456

Ensembl

ENSG00000158769

ENSMUSG00000038235

UniProt

Q9Y624

O88792

RefSeq (мРНК)
NM_016946
NM_144501
NM_144502
NM_144503
NM_144504

NM_001348091
NM_001382727
NM_001382730
NM_001382733
NM_001382734

NM_172647

RefSeq (белок)
NP_058642
NP_001335020
NP_001369656
NP_001369659
NP_001369662

NP_001369663

NP_766235

Локус (UCSC)Chr 1: 161 – 161.02 MbChr 1: 171.27 – 171.29 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

F11R (англ. F11 receptor; Junctional adhesion molecule A; CD321) — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов, продукт гена человека F11R[5][6][7].

Функции

Плотные контакты представляют собой важный компонент в межклеточной адгезии, которая играет критическую роль в образовании эпителиальных и эндотелиальных клеточных слоёв. Плотные контакты образуют «сшивку» между клетками, которая предотвращает свободное перемещение воды и растворённых веществ в околоклеточном пространстве. F11R — белок из суперсемейства иммуноглобулинов, важный регулятор сборки плотных контактов в эпителии. Кроме этого, F11R служит рецептором для реовирусов; лигандом интегрина LFA-1, который играет роль в лейкоцитарной трансмиграции, и лигандом тромбоцитов. Существует две изоформы белка[7].

Структура

F11R состоит из 299 аминокислот, молекулярная масса 32,6 кДа.

Взаимодействия

F11R связывается с MLLT4[8], CASK[8][9] и TJP1/ZO-1.[8][10]

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000158769 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038235 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Ozaki H, Ishii K, Horiuchi H, Arai H, Kawamoto T, Okawa K, Iwamatsu A, Kita T (Jul 1999). "Cutting edge: combined treatment of TNF-alpha and IFN-gamma causes redistribution of junctional adhesion molecule in human endothelial cells". Journal of Immunology. 163 (2): 553—7. PMID 10395639.
  6. ↑ Naik UP, Ehrlich YH, Kornecki E (Aug 1995). "Mechanisms of platelet activation by a stimulatory antibody: cross-linking of a novel platelet receptor for monoclonal antibody F11 with the Fc gamma RII receptor". The Biochemical Journal. 310 ( Pt 1) (1): 155—62. doi:10.1042/bj3100155. PMC 1135867. PMID 7646439.
  7. ↑ 1 2 Entrez Gene: F11R F11 receptor  (неопр.).
  8. ↑ 1 2 3 Ebnet K, Schulz CU, Meyer Zu Brickwedde MK, Pendl GG, Vestweber D (Sep 2000). "Junctional adhesion molecule interacts with the PDZ domain-containing proteins AF-6 and ZO-1". The Journal of Biological Chemistry. 275 (36): 27979—88. doi:10.1074/jbc.M002363200. PMID 10856295.
  9. ↑ Martinez-Estrada OM, Villa A, Breviario F, Orsenigo F, Dejana E, Bazzoni G (Mar 2001). "Association of junctional adhesion molecule with calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (CASK/LIN-2) in human epithelial caco-2 cells". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9291—6. doi:10.1074/jbc.M006991200. PMID 11120739.
  10. ↑ Ebnet K, Aurrand-Lions M, Kuhn A, Kiefer F, Butz S, Zander K, Meyer zu Brickwedde MK, Suzuki A, Imhof BA, Vestweber D (Oct 2003). "The junctional adhesion molecule (JAM) family members JAM-2 and JAM-3 associate with the cell polarity protein PAR-3: a possible role for JAMs in endothelial cell polarity". Journal of Cell Science. 116 (Pt 19): 3879—91. doi:10.1242/jcs.00704. PMID 12953056.

Литература

  • Muller WA (Jun 2003). "Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response". Trends in Immunology. 24 (6): 327—34. doi:10.1016/S1471-4906(03)00117-0. PMID 12810109.
  • Bazzoni G (Oct 2003). "The JAM family of junctional adhesion molecules". Current Opinion in Cell Biology. 15 (5): 525—30. doi:10.1016/S0955-0674(03)00104-2. PMID 14519386.
  • Naik UP, Eckfeld K (2004). "Junctional adhesion molecule 1 (JAM-1)". Journal of Biological Regulators and Homeostatic Agents. 17 (4): 341—7. PMID 15065765.
  • Kornecki E, Walkowiak B, Naik UP, Ehrlich YH (Jun 1990). "Activation of human platelets by a stimulatory monoclonal antibody". The Journal of Biological Chemistry. 265 (17): 10042—8. PMID 2351647.
  • Williams LA, Martin-Padura I, Dejana E, Hogg N, Simmons DL (Dec 1999). "Identification and characterisation of human Junctional Adhesion Molecule (JAM)". Molecular Immunology. 36 (17): 1175—88. doi:10.1016/S0161-5890(99)00122-4. PMID 10698320.
  • Sobocka MB, Sobocki T, Banerjee P, Weiss C, Rushbrook JI, Norin AJ, Hartwig J, Salifu MO, Markell MS, Babinska A, Ehrlich YH, Kornecki E (Apr 2000). "Cloning of the human platelet F11 receptor: a cell adhesion molecule member of the immunoglobulin superfamily involved in platelet aggregation". Blood. 95 (8): 2600—9. doi:10.1182/blood.V95.8.2600. PMID 10753840.
  • Liu Y, Nusrat A, Schnell FJ, Reaves TA, Walsh S, Pochet M, Parkos CA (Jul 2000). "Human junction adhesion molecule regulates tight junction resealing in epithelia". Journal of Cell Science. 113 ( Pt 13) (13): 2363—74. PMID 10852816.
  • Ebnet K, Schulz CU, Meyer Zu Brickwedde MK, Pendl GG, Vestweber D (Sep 2000). "Junctional adhesion molecule interacts with the PDZ domain-containing proteins AF-6 and ZO-1". The Journal of Biological Chemistry. 275 (36): 27979—88. doi:10.1074/jbc.M002363200. PMID 10856295.
  • Bazzoni G, Martinez-Estrada OM, Orsenigo F, Cordenonsi M, Citi S, Dejana E (Jul 2000). "Interaction of junctional adhesion molecule with the tight junction components ZO-1, cingulin, and occludin". The Journal of Biological Chemistry. 275 (27): 20520—6. doi:10.1074/jbc.M905251199. PMID 10877843.
  • Gupta SK, Pillarisetti K, Ohlstein EH (Jul 2000). "Platelet agonist F11 receptor is a member of the immunoglobulin superfamily and identical with junctional adhesion molecule (JAM): regulation of expression in human endothelial cells and macrophages". IUBMB Life. 50 (1): 51—6. doi:10.1080/15216540050176593. PMID 11087121. S2CID 37733691.
  • Martinez-Estrada OM, Villa A, Breviario F, Orsenigo F, Dejana E, Bazzoni G (Mar 2001). "Association of junctional adhesion molecule with calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (CASK/LIN-2) in human epithelial caco-2 cells". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9291—6. doi:10.1074/jbc.M006991200. PMID 11120739.
  • Naik UP, Naik MU, Eckfeld K, Martin-DeLeon P, Spychala J (Feb 2001). "Characterization and chromosomal localization of JAM-1, a platelet receptor for a stimulatory monoclonal antibody". Journal of Cell Science. 114 (Pt 3): 539—47. PMID 11171323.
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Research. 11 (3): 422—35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
  • Barton ES, Forrest JC, Connolly JL, Chappell JD, Liu Y, Schnell FJ, Nusrat A, Parkos CA, Dermody TS (Feb 2001). "Junction adhesion molecule is a receptor for reovirus". Cell. 104 (3): 441—51. doi:10.1016/S0092-8674(01)00231-8. PMID 11239401. S2CID 17095289.
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (Sep 2000). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Reports. 1 (3): 287—92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
  • Ebnet K, Suzuki A, Horikoshi Y, Hirose T, Meyer Zu Brickwedde MK, Ohno S, Vestweber D (Jul 2001). "The cell polarity protein ASIP/PAR-3 directly associates with junctional adhesion molecule (JAM)". The EMBO Journal. 20 (14): 3738—48. doi:10.1093/emboj/20.14.3738. PMC 125258. PMID 11447115.
  • Itoh M, Sasaki H, Furuse M, Ozaki H, Kita T, Tsukita S (Aug 2001). "Junctional adhesion molecule (JAM) binds to PAR-3: a possible mechanism for the recruitment of PAR-3 to tight junctions". The Journal of Cell Biology. 154 (3): 491—7. doi:10.1083/jcb.200103047. PMC 2196413. PMID 11489913.
  • Hamazaki Y, Itoh M, Sasaki H, Furuse M, Tsukita S (Jan 2002). "Multi-PDZ domain protein 1 (MUPP1) is concentrated at tight junctions through its possible interaction with claudin-1 and junctional adhesion molecule". The Journal of Biological Chemistry. 277 (1): 455—61. doi:10.1074/jbc.M109005200. PMID 11689568.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400