Enterobacter

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Enterobacter

Culture de E. cloacae sur GTS

Classification
Domaine	Bacteria
Embranchement	Pseudomonadota
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Enterobacterales
Famille	Enterobacteriaceae

Genre

Enterobacter
Hormaeche & Edwards 1960

Enterobacter est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Enterobacteriaceae. Son nom, composé du grec enteron (ἒντερον : intestin) et du néolatin bacter (petit bacille), peut se traduire par « petit bacille intestinal »^[1].

L'habitat est l'intestin de l'Homme et des animaux, Enterobacter est aussi trouvé dans les selles, les eaux d'égouts, le sol, les produits laitiers. Certaines souches du genre Enterobacter peuvent être responsables d'infections nosocomiales.

Taxonomie

Jusqu'en 2016 ce genre était rattaché par des critères phénotypiques à la famille des Enterobacteriaceae. Malgré la refonte de l'ordre des Enterobacterales par Adeolu et al. en 2016 à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, Enterobacter reste dans la famille des Enterobacteriaceae dont le périmètre redéfini compte néanmoins beaucoup moins de genres qu'auparavant^[2].

Liste d'espèces

Selon la LPSN (31 octobre 2022)^[3] :

Enterobacter asburiae Brenner et al. 1988
Enterobacter bugandensis Doijad et al. 2016
Enterobacter cancerogenus (Urosevic 1966) Dickey & Zumoff 1988
Enterobacter chengduensis Wu et al. 2019
Enterobacter chuandaensis Wu et al. 2019
Enterobacter cloacae (Jordan 1890) Hormaeche & Edwards 1960 – espèce type
Enterobacter dykesii Cho et al. 2021
Enterobacter hormaechei O'Hara et al. 1990
Enterobacter huaxiensis Wu et al. 2019
Enterobacter kobei Kosako et al. 1997
Enterobacter ludwigii Hoffmann et al. 2005
Enterobacter mori Zhu et al. 2011
Enterobacter oligotrophicus corrig. Akita et al. 2020
Enterobacter quasihormaechei Wang et al. 2020
Enterobacter quasimori Wu et al. 2021
Enterobacter quasiroggenkampii Wu et al. 2020
Enterobacter roggenkampii Sutton et al. 2018
Enterobacter siamensis Khunthongpan et al. 2014
Enterobacter sichuanensis Wu et al. 2018
Enterobacter soli Manter et al. 2011
Enterobacter vonholyi Cho et al. 2021
Enterobacter wuhouensis Wang et al. 2020

Des reclassements ont été effectués au sein même du genre Enterobacter :

Enterobacter asburiae : reclassement de E. muelleri
Enterobacter cancerogenus : reclassement de E. taylorae
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens : reclassement de E. dissolvens
Enterobacter mori : reclassement de Enterobacter tabaci
Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis : reclassement de E. xiangfangensis

Par ailleurs, un grand nombre d'espèces auparavant classées parmi les Enterobacter ont été reclassées dans d'autres genres :

Cronobacter sakazakii (Farmer et al. 1980) Iversen et al. 2008 : reclassement de E. sakazakii
Franconibacter helveticus (Stephan et al. 2007) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. helveticus
Franconibacter pulveris (Stephan et al. 2008) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. pulveris
Klebsiella aerogenes (Hormaeche & Edwards 1960) Tindall et al. 2017 : reclassement de E. aerogenes
Kluyvera intermedia (Izard et al. 1980) Pavan et al. 2005 : reclassement de E. intermedius
Kosakonia arachidis (Madhaiyan et al. 2010) Brady et al. 2013 : reclassement de E. arachidis
Kosakonia cowanii (Inoue et al. 2001) Brady et al. 2013 : reclassement de E. cowanii
Kosakonia oryzae (Peng et al. 2009) Brady et al. 2013 : reclassement de E. oryzea
Kosakonia oryzendophytica (Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016 : reclassement de E. oryzendophyticus
Kosakonia oryziphila (Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016 : reclassement de E. oryziphilus
Kosakonia radicincitans (Kämpfer et al. 2005) Brady et al. 2013 : reclassement de E. radicincitans
Kosakonia sacchari (Zhu et al. 2013) Gu et al. 2014 : reclassement de E. sacchari
Lelliottia amnigena (Izard et al. 1981) Brady et al. 2013 : reclassement de E. amniogenus
Lelliottia nimipressuralis (Carter 1945) Brady et al. 2013 : reclassement de E. nimipressuralis
Pantoea agglomerans (Beijerinck 1888) Gavini et al. 1989 : reclassement de E. agglomerans
Phytobacter massiliensis (Lagier et al. 2014) Ma et al. 2021 : reclassement de E. massiliensis
Pluralibacter gergoviae (Brenner et al. 1980) Brady et al. 2013 : reclassement de E. gergoviae
Pluralibacter pyrinus (Chung et al. 1993) Brady et al. 2013 : reclassement de E. pyrinus
Siccibacter turicensis (Stephan et al. 2007) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. turicensis

Bibliographie

(en) thèse en ligne (Université de Wageningen University) - 2010 Detection, occurrence, growth and inactivation of Cronobacter spp.
(en) 2011 Enterobacter sakazakii: an emerging foodborne pathogenic bacterium

Notes et références

↑ Hormaeche E & Edwards PR « A proposed genus Enterobacter » Int J Syst Evol Microbiol. 1960;10(2):71-74. Accès libre.
↑ Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575-5599. Accès libre.
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 31 octobre 2022

Liens externes

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Enterobacter, sur Wikispecies

(en) Référence BioLib : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le 8 mars 2020)
(en) Référence Catalogue of Life : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le 11 décembre 2020)
(fr + en) Référence ITIS : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le 8 mars 2020)
(en) Référence NCBI : Enterobacter "Cloaca" Castellani & Chalmers 1919 (taxons inclus) (consulté le 8 mars 2020)
(en) Référence WoRMS : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (+ liste espèces) (consulté le 8 mars 2020)